豚鼠的品种较多，依据毛的特性不同，可分为短毛种、长毛种和硬笔种三种。短毛种主要有：
(1)荷兰种。俗称“荷兰鼠”。被毛严密有光泽，部分毛为白色，部分毛为褐色、蓝色或灰色。白色毛主要在豚鼠躯干的前部、头部和后腿脚掌，所以又称为“白裤脚”。这种豚鼠的特色：性格温顺生动，繁衍力强，带仔好，抗病力强。
(2)喜马拉雅种。俗称“天竺鼠”。嘴脸为黑色或黑褐色，脸上部为深黑色，耳朵、前后肢以及阴囊为黑色，其他遍地均为白色。这种豚鼠的四肢和嘴脸部黑斑是逐步呈现的：初生下来时，豚鼠被毛全为白色，至第4周，脸上呈现不大的黑斑，今后逐步变大变黑；至第4个月，在上述部位长出本种豚鼠特有毛色。雌鼠均匀每胎产仔3-4只，且带仔好。
(3)南美洲种。此种豚鼠有两种毛色——黄褐色（金色南美洲种）和灰色（灰色南美洲种）。黑毛均匀地散布于全身，但不构成黑色斑驳，这是一种最艳丽的色泽。金色南美洲种豚鼠的腹部毛色为棕黄色，而灰色南美洲种豚鼠的腹部为银灰色。这种豚鼠的主要特征为：早熟，繁衍力强，抗病力强，母鼠乳汁丰厚，带仔好。
(4)白龟甲种。在常见的豚鼠中，白色龟甲种豚鼠是最美丽的。它的被毛有黑色、棕黄色和白色3种色斑，各色斑规整而对称地散布在身体的两边。这种豚鼠的特征是早熟，繁衍力强。
(5)白色种。此种豚鼠的毛全为白色，耳朵和爪甲也全为白色，眼睛为赤色，且比较大。
长毛豚鼠主要有秘鲁种和安哥拉种。这类豚鼠的特征是被毛稠密，长并且柔软如丝，特别是臀部和前肢的被毛更是如此。它的头部被毛遮盖了整个头部和鼻面，披肩的长毛构成如猿的毛丛。这种豚鼠的毛色繁复，有棕黄色、黑色、灰色、天蓝色等等。在长毛豚鼠中，秘鲁种能够作为试验动物用。安哥拉种繁衍力低，母鼠带仔欠好，但能够作为欣赏动物。
硬毛豚鼠主要有埃塞俄比亚种、日本种、蔷薇花种和多额发种。这类豚鼠的原始种披盖着长而硬的被毛，被毛像蔷薇的花朵相同，散布在全身，不混合，被毛从圆心打开，如同花蕊（卷须），毛色为黑色、棕黄色或白色。这种豚鼠的性格浮躁，易激怒，对各种疾病都十分灵敏。
